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마르틴 카르플루스(영어: Martin Karplus, 1930년 3월 15일~2024년 12월 28일)는 미국의 이론화학자이다. 2013년에 컴퓨터로 화학 반응을 예측하고 이해하는데 이론적 기초를 제공한 공로를 인정받아 마이클 레빗, 아리 워셜과 함께 노벨 화학상을 수상하였다.