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존 버넷 펜(영어: John Bennett Fenn, 1917년 6월 15일 ~ 2010년 12월 10일)은 미국의 분석화학자이다. 2002년에 생체 고분자의 질량 분석법을 위한 온화하는 이탈 이온화법을 개발한 공로로 다나카 고이치, 쿠르트 뷔트리히와 함께 노벨 화학상을 수상했다.
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